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河南農(nóng)業(yè)大學(xué)夏平安團隊:PRRSV GP5 通過靶向 LAMP2A 抑制分子伴侶介導(dǎo)的自噬的抗病毒作用

噬是宿主防御病毒感染的重要生物學(xué)過程,然而許多病毒進(jìn)化出了各種策略來破壞宿主的抗病毒系統(tǒng)。一些其他病毒誘導(dǎo)自噬,然后劫持自噬體并將其用作復(fù)制位點,或劫持分泌性自噬途徑以促進(jìn)病毒顆粒的成熟和排出,從而增加復(fù)制。豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)以其狡猾的免疫逃逸策略,給全球養(yǎng)豬業(yè)帶來了前所未有的挑戰(zhàn)。這種病毒不僅能夠引發(fā)豬只的嚴(yán)重疾病,更通過精妙的機制操縱宿主的自噬過程,來增強其生存和復(fù)制能力。目前,關(guān)于PRRSV在自噬過程中的逃逸機制,特別是通過分子伴侶介導(dǎo)的自噬(CMA)的研究有限。

2024年06月28日,河南農(nóng)業(yè)大學(xué)夏平安團隊在國際期刊 mBio 上發(fā)表題為“ PRRSV GP5 inhibits the antivirus effects of chaperone-mediated autophagy by targeting LAMP2A”的最新研究論文,該研究對PRRSV在自噬過程中的逃逸機制,特別是通過分子伴侶介導(dǎo)的自噬(CMA)的研究提供了新的見解。

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 IF:5.1    中科院1區(qū)  |  JCR/Q1  生物學(xué) 

參考譯文:PRRSV GP5 通過靶向 LAMP2A 抑制分子伴侶介導(dǎo)的自噬的抗病毒作用

第一作者:Wen Li 

通訊作者:夏平安,張宜娜,陳靜


I 主要研究結(jié)果

1.  PRRSV 感染可誘導(dǎo)不完全自噬
PRRSV感染促進(jìn)了自噬體的形成,但同時阻礙了自噬體與溶酶體的融合,導(dǎo)致不完全自噬。通過對PAMs和MARC-145細(xì)胞在PRRSV感染后的觀察,可以注意到自噬標(biāo)記物L(fēng)C3-II和自噬底物SQSTM1的顯著積累,這表明雖然自噬體形成增加,但降解功能受阻。使用RFP-GFP-LC3報告基因,可以證實PRRSV感染的細(xì)胞中自噬體與溶酶體融合受損,這由RFP和GFP雙陽性囊泡的積累增加所體現(xiàn)。此外,PRRSV感染減少了自噬體標(biāo)記LC3與溶酶體標(biāo)記LAMP2A的共定位,進(jìn)一步證實了融合過程的抑制。這些發(fā)現(xiàn)揭示了PRRSV操縱宿主自噬機制促進(jìn)其復(fù)制的新機制。

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圖1. PRRSV 感染誘導(dǎo)不完全自噬

2.  GP5是PRRSV誘導(dǎo)自噬的主要調(diào)節(jié)因子

 為了研究PRRSV如何導(dǎo)致感染細(xì)胞自噬活性發(fā)生這種劇烈變化,探索了負(fù)責(zé)阻斷自噬的病毒蛋白。用表達(dá)GP3、GP4、GP5、M或N的載體轉(zhuǎn)染HEK293T或MARC-145細(xì)胞,檢查了內(nèi)源性LC3 I向LC3 II的轉(zhuǎn)化以及SQSTM1的積累。結(jié)果表明,GP5的過表達(dá)顯著促進(jìn)了LC3-II的形成并增加了SQSTM1的蛋白質(zhì)水平。GP5可能導(dǎo)致RFP和GFP雙陽性囊泡(黃色斑點)的積累,表明自噬體和溶酶體的融合被阻斷。此外,GP5明顯降低了LC3和LAMP2A的共定位。這些結(jié)果表明GP5是PRRSV誘導(dǎo)的自噬的主要抑制劑。然而,GP5對LAMP2A的結(jié)合親和力可能比LC3更大。因此,推測GP5介導(dǎo)的自噬抑制可能主要與溶酶體有關(guān)。

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圖2. GP5 是 PRRSV 誘導(dǎo)自噬的主要調(diào)節(jié)劑

3.  GP5 與 CMA 關(guān)鍵蛋白 HSC70 和 LAMP2A 相互作用

通過共免疫沉淀(co-IP)結(jié)合液相色譜-質(zhì)譜(LC-MS/MS)技術(shù)在PAMs細(xì)胞中鑒定了與GP5相互作用的蛋白質(zhì)。實驗結(jié)果顯示HSC70和LAMP2A是與GP5相互作用的蛋白。進(jìn)一步的實驗驗證了GP5與HSC70和LAMP2A的相互作用,并發(fā)現(xiàn)GP5能夠與HSC70競爭性結(jié)合LAMP2A,從而破壞LAMP2A-HSC70復(fù)合體的形成。

此外,盡管GP5含有類似CMA(分子伴侶介導(dǎo)的自噬)基序的五肽序列“QKFDW”,但研究表明GP5并非CMA的底物。通過構(gòu)建GP5突變體并進(jìn)行實驗,研究人員發(fā)現(xiàn)即使在突變體中,GP5仍然能夠與HSC70相互作用,并且HSC70促進(jìn)了GP5的表達(dá)而非降解。這表明GP5與HSC70的相互作用區(qū)域并非GP5上的“QKFDW”序列。

最后,通過預(yù)測GP5的結(jié)構(gòu)域并構(gòu)建突變體,研究人員確定了GP5的N端66-88和126-201氨基酸區(qū)域是與HSC70相互作用的關(guān)鍵區(qū)域。這些發(fā)現(xiàn)為理解GP5如何通過靶向LAMP2A抑制CMA提供了重要信息,并且揭示了PRRSV逃避宿主細(xì)胞自噬機制的新策略。

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圖3.GP5 通過競爭性結(jié)合 LAMP2A 來破壞 LAMP2A 和 HSC70 之間的相互作用

4.  GP5 通過抑制 MTORC2/PHLPP1/GFAP 通路降低 CMA 活性

由于GP5不是CMA的底物,但能與LAMP2A競爭性結(jié)合,研究者推測GP5可能通過與LAMP2A的相互作用來調(diào)控CMA的活性。實驗結(jié)果顯示,GP5過表達(dá)或PRRSV感染的細(xì)胞中,關(guān)鍵CMA蛋白PHLPP1、GFAP和LAMP2A的水平下降,同時GFAP的磷酸化水平上升,表明GP5通過抑制MTORC2/PHLPP1/GFAP信號通路來降低CMA活性。

為了評估CMA活性,研究者使用了一種光轉(zhuǎn)換的人工CMA報告分子KFERQ-PA-mCherry,該分子在405納米可見光照射下會由非熒光變?yōu)榧t色熒光,使溶酶體呈現(xiàn)紅色熒光斑點。紅色斑點的數(shù)量是CMA活性的可靠指標(biāo)。實驗觀察到,GP5過表達(dá)或PRRSV感染的MARC-145細(xì)胞中紅色熒光斑點數(shù)量減少,這進(jìn)一步證實了PRRSV通過GP5降低了CMA的活性。

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圖4.GP5 降低 CMA 的活性

5.GP5 通過解離未修飾的 GFAP-LAMP2A 復(fù)合物來加速 LAMP2A 的分解

研究發(fā)現(xiàn)GP5能夠上調(diào)GFAP的磷酸化并下調(diào)LAMP2A的表達(dá),這可能是GP5破壞CMA的一個重要因素。通過共免疫沉淀和間接免疫熒光實驗,觀察到GP5與EF1α而非GFAP相互作用。此外,GP5在存在時減少了LAMP2A與去磷酸化突變體GFAP (S8A)的相互作用,并破壞了GFAP (S8D)與EF1α的結(jié)合。這些結(jié)果表明GP5促進(jìn)了pGFAP-EF1α復(fù)合體的解聚,導(dǎo)致未修飾的GFAP從多聚體LAMP2A上解離,從而瓦解LAMP2A,降低了CMA的活性。

進(jìn)一步的實驗評估了GFAP對PRRSV復(fù)制的影響,結(jié)果顯示GFAP (S8D)降低了LAMP2A的表達(dá),增加了細(xì)胞裂解液中的PRRSV N蛋白水平和病毒基因組拷貝數(shù),以及培養(yǎng)上清中的病毒產(chǎn)量。相反,GFAP (S8A)能夠維持LAMP2A的穩(wěn)定性,減少PRRSV N蛋白水平、病毒基因組拷貝數(shù)和病毒產(chǎn)量。因此,研究推測CMA活性的變化可能會影響PRRSV的增殖。

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圖5. GP5 解離未修飾的 GFAP-LAMP2A 復(fù)合物

6.GP5 通過阻斷 K63 連接的多泛素化來損害 LAMP2A 的穩(wěn)定性

研究發(fā)現(xiàn),隨著GP5劑量的增加,LAMP2A蛋白水平呈劑量依賴性下降,而LAMP2A的mRNA水平?jīng)]有顯著變化,表明GP5可能通過降低LAMP2A的穩(wěn)定性來促進(jìn)其降解。通過使用蛋白酶體抑制劑MG132和溶酶體抑制劑CQ的實驗,結(jié)果表明GP5通過泛素-蛋白酶體途徑促進(jìn)LAMP2A的降解,而非通過溶酶體途徑。特別是,GP5過度表達(dá)顯著抑制了LAMP2A的K63連接的多聚泛素化,這表明GP5通過破壞LAMP2A的K63連接多聚泛素化來減弱其穩(wěn)定性,從而促進(jìn)其降解。

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圖6.GP5 通過 UPS 削弱 LAMP2A 的蛋白質(zhì)穩(wěn)定性

7.GP5 抑制 CMA 的抗病毒作用

研究發(fā)現(xiàn),LAMP2A的過表達(dá)能夠降低PRRSV N蛋白水平、病毒基因組拷貝數(shù),以及減少培養(yǎng)上清中的病毒產(chǎn)量。相反,通過siRNA技術(shù)敲低LAMP2A的表達(dá)則會增加PRRSV的復(fù)制。此外,利用饑餓(一種CMA激活劑)處理PRRSV感染的細(xì)胞,能夠減少病毒的復(fù)制,而使用NH4Cl和亮抑素(CMA抑制劑)則會增加病毒復(fù)制。

進(jìn)一步的實驗表明,GP5通過減少LAMP2A蛋白水平,增加PRRSV N蛋白水平和病毒基因組拷貝數(shù),進(jìn)而提高病毒產(chǎn)量,從而抑制CMA的激活。為了理解CMA的抗病毒機制,研究人員使用西方印跡法篩選被CMA降解的PRRSV病毒蛋白,發(fā)現(xiàn)CMA激活能顯著降低NSP11的表達(dá)。NSP11已知能減少干擾素-β的表達(dá),并且抑制RIG-I的活性。通過雙重?zé)晒馑孛笀蟾婊蚝臀鞣接≯E法的實驗,研究人員發(fā)現(xiàn)CMA激活能夠顯著提高NSP11過表達(dá)細(xì)胞中IFN-β啟動子的活性和RIG-I的表達(dá),表明CMA激活能夠抵消NSP11介導(dǎo)的對IFN-I信號通路的抑制。這些發(fā)現(xiàn)表明GP5通過靶向LAMP2A抑制CMA的激活,增強了NSP11對RIG-I介導(dǎo)的IFN-I信號通路的抑制作用,從而促進(jìn)PRRSV的復(fù)制。

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圖7.CMA 的激活可抑制 PRRSV 復(fù)制

研究總結(jié)

GP5對CMA的抑制作用

本研究得出結(jié)論,PRRSV的GP5蛋白通過靶向LAMP2A顯著抑制了CMA的活性。通過減少LAMP2A的蛋白水平,GP5破壞了CMA過程中必需的GFAP-LAMP2A復(fù)合體的形成,進(jìn)而影響了CMA的底物遞呈和溶酶體降解。此外,GP5通過干擾K63連接的多聚泛素化過程,加速了LAMP2A的蛋白降解,進(jìn)一步削弱了CMA的抗病毒功能。

CMA活性與PRRSV復(fù)制的相關(guān)性

研究結(jié)果表明,CMA活性的調(diào)節(jié)直接影響PRRSV的復(fù)制能力。當(dāng)CMA活性被激活時,如通過饑餓處理,PRRSV的復(fù)制受到抑制;相反,當(dāng)CMA活性被抑制時,例如使用NH4Cl和亮抑素處理,PRRSV的復(fù)制能力得到增強。此外,通過siRNA技術(shù)敲低LAMP2A的表達(dá),也證實了CMA活性的降低會促進(jìn)PRRSV的復(fù)制。

GP5對PRRSV免疫逃逸的貢獻(xiàn)

最后,本研究揭示了GP5在PRRSV免疫逃逸中的作用機制。GP5不僅通過抑制CMA活性來促進(jìn)病毒復(fù)制,還通過影響NSP11介導(dǎo)的IFN-I信號通路來增強PRRSV的免疫抑制作用。這些發(fā)現(xiàn)為理解PRRSV如何在宿主細(xì)胞內(nèi)建立感染和復(fù)制提供了新的視角,并為開發(fā)新的抗病毒策略提供了潛在的分子靶點。

源論文鏈接

DOI: https://doi.org/10.1128/mbio.00532-24